Родившийся в Сиэтле, штат Вашингтон, Гордон Фримен еще в молодости проявил интерес к квантовой физике. Его героями были Эйнштейн, Ноукинг и Фейнман.
В конце девяностых годов, во время учебы в Университете Инсбрука, Гордон присутствовал на ранних экспериментах по телепортации, проведенных Институтом Экспериментальной Физики.
Разочарованный малой скоростью и низким бюджетом академических исследований и охваченный своей мечтой, Гордон ищет работу в частном секторе. И фортуна улыбнулась ему — его наставник в M.I.T., профессор Айзек Кляйнер, возглавил исследовательский проект на списанной ракетной базе Black Mesa в Нью-Мехико. Клейнеру были нужны способные помощники, и выбор пал на Фримена.
Учитывая источники и размеры финансирования, Гордон подозревал, что разработки ведутся в области вооружений, но он также надеялся, что гражданское применение технологиям также будет найдено, а потому — он принял предложение Клейнера. До инцидента в Black Mesa Гордон никогда не имел дела с оружием, если не считать пушки, стрелявшей теннисными мячиками, которую он сконструировал в 6 лет.
Пробив свой путь сквозь разломы пространства к финальной аудиенции с человеком, известным как G-Man, Фримен согласился работать на него, надеясь помочь человечеству. Прошли годы с тех пор, как кто-либо из его коллег слышал, что-либо о Гордоне. И мир изменился за эти годы.